住宅地震保險基金之董事會為最高決策機構，由董事長為代表人，並設置專任稽核人員一名，隸屬董事會，執行稽核業務。設置監察人，監督地震保險基金之業務及財務。另成立住宅地震保險制度發展規劃工作小組，協助地震保險基金檢討改善現行保險制度，強化地震保險基金中樞組織之功能，該工作小組由地震保險基金總經理擔任召集人。另於總經理及副總經理之下設置業務處、管理處兩部門，各置主管一人，分別掌理部門業務。